肠道微生物检测
扩增子测序通过对一定长度的PCR扩增子进行测序,研究环境样品中的微生物多样性,主要包括16S rDNA测序(用于细菌或古菌多样性研究)、18S rDNA测序和ITS测序(用于真菌或微小动植物等多样性研究)等。通过提取环境样品的DNA,选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS序列的某一或某几个高度变异区,采用Illumina MiSeq高通量测序平台将目的区域正反向读通,通过检测目的区域的序列变异和丰度,对环境样本物种分类及丰度、种群结构、系统进化、群落距离等方面信息进行分析。探讨微生物多样性,对于研究微生物与环境的关系、环境治理和微生物资源利用有着重要的理论和现实意义。
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