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疾病与药物研究

科学家描绘肝癌药物基因组学 “蓝图”

2019年08月15日 浏览量: 评论(0) 来源:中国科学报 作者:中国科学报 责任编辑:admin
摘要:中国科学院分子细胞科学卓越创新中心惠利健研究组、中国科学院上海营养与健康研究所李亦学研究组、第二军医大学附属东方肝胆外科医院张海斌研究组以及南京大学医学院附属鼓楼医院施晓雷等取得一项新进展。他们的研究公布了目前最大的肝癌细胞模型库 LIMORE 及最详细的药物基因组学。这一成果发表在 8 月 12 日出版的《癌细胞》上。
《癌细胞》:第 36 卷第 2 期
 
中国科学院分子细胞科学卓越创新中心惠利健研究组、中国科学院上海营养与健康研究所李亦学研究组、第二军医大学附属东方肝胆外科医院张海斌研究组以及南京大学医学院附属鼓楼医院施晓雷等取得一项新进展。他们的研究公布了目前最大的肝癌细胞模型库 LIMORE 及最详细的药物基因组学。这一成果发表在 8 月 12 日出版的《癌细胞》上。
 
为了表征肝癌中药物基因组相互作用的情况,研究人员开发了一种方案,以大约 50% 的成功率建立人肝癌细胞模型,并用 81 个细胞模型生成肝癌模型库(LIMORE)。LIMORE 能够代表原发癌的基因组和转录组异质性。对 LIMORE 药物基因组学领域的研究发现了新的基因—药物关联,包括对肝癌普遍改变的合成致死率。此外,这也为选择索拉非尼响应患者提供了预测性生物标志候选物。LIMORE 为促进肝癌的药物发现提供了丰富的资源。
 
据了解,肝癌具有高度异质性、预后差以及药物反应差等特征。更好地理解基因改变和药物反应之间的关系将有助于肝癌的精确治疗。
 
相关论文信息:https://doi.org/10.1016/j.ccell.2019.07.001
 
唐氏综合征患儿白血病进展机制
 
8 月 12 日出版的《癌细胞》杂志发表了一项最新研究成果。来自德国马丁路德 · 哈勒维腾贝格大学的 Jan-Henning Klusmann、Dirk Heckl 研究组和牛津大学 Paresh Vyas 研究组,合作揭示了唐氏综合征患儿髓系白血病前期向髓系白血病转化的进展机制。
 
唐氏综合征(ML-DS)中的髓系白血病是从短暂的异常骨髓细胞生成(TAM,DS 新生儿的白血病前期)发展形成。为了确定白血病转化的机制,研究人员联合分析了 111 个 TAM 和 141 个 ML-DS 样本的外显子组和靶向重测序与功能。TAM 需要 21 - 三体(3 条 21 号染色体)以及截短的 GATA1 突变;其他的 TAM 突变通常不致病。相反,在 ML-DS 中,功能上需要克隆和亚克隆变体。研究人员在骨髓细胞因子受体 CSF2RB 中发现了复发性和致癌性功能获得性热点突变。通过小鼠 TAM 体内模型中的多重 CRISPR / Cas9 筛选,研究人员测试了 22 个 ML-DS 高频突变基因的功能丧失。18 种不同基因的丢失产生了表型、遗传和转录相似的 ML-DS 白血病。
 
相关论文信息:https://doi.org/10.1016/j.ccell.2019.06.007
 
《自然—医学》:第 25 卷第 8 期
 
单细胞测序揭示冠状动脉疾病保护机制
 
美国斯坦福大学医学院 Thomas Quertermous 研究组取得新进展。他们利用单细胞测序揭示了平滑肌细胞表型转化与疾病基因 TCF21 在动脉粥样硬化过程中的保护作用。《自然—医学》8 月发表了这一成果。
 
使用单细胞 RNA 测序,研究人员在小鼠和人动脉的动脉粥样硬化病变中全面表征了血管平滑肌细胞(SMC)体内表型转化的转录组,并发现这些细胞转化为独特的成纤维细胞样细胞,被命名为 “fibromyocyte”,而不是经典的巨噬细胞表型。SMC 中特异性敲除 TCF21(一个导致 CAD 的基因)能够显著抑制小鼠中的 SMC 表型转化,从而导致病变内以及病变的保护性纤维帽内存在较少的 fibromyocyte。此外,TCF21 表达与患者冠状动脉中的 SMC 表型转化显著相关,并且较高水平的 TCF21 表达与人 CAD 相关组织中降低的 CAD 风险相关。这些结果确立了 TCF21 和 SMC 表型转化在该疾病中的保护作用。
 
据介绍,为响应各种刺激,SMC 可以去分化、增殖和迁移,这一过程被称为表型转化。然而,动脉粥样硬化时 SMC 的体内表型转化以及该过程对冠状动脉疾病风险的影响尚不明确。
 
相关论文信息:https://doi.org/10.1038/s41591-019-0512-5
 
《英国医学杂志》:第 366 卷第 8210 期
 
中年理想心血管健康与痴呆发生率的关系
 
法国巴黎大学 Séverine Sabia 课题组探讨了 50 岁时理想心血管健康与痴呆发生率的关系:白厅 II 队列研究进行了 25 年随访。相关论文于 8 月 10 日发表在《英国医学杂志》。
 
本研究的目的是探讨 50 岁时心血管健康 7 项生活简易评分与痴呆发病率的关系。7899 名参与者在 50 岁时进行了心血管健康评分,包括四项行为指标(吸烟、饮食、体育活动、体重指数)和 3 项生物指标(空腹血糖、血胆固醇、血压),每项 0、1、2 分。根据总分将患者分为心血管健康最佳组、中等组和不佳组。
 
中位随访 24.7 年后,共有 347 例参与者患上痴呆症。心血管健康不佳组中痴呆发病率为每 1000 人年 3.2,中等组为 1.7,最佳组为 1.3。心血管健康评分越高,痴呆风险越低。随访期间还发现 50 岁时心血管健康与痴呆的相关性也适用于没有心血管疾病的人群。
 
研究结果表明,中年时坚持理想心血管健康七项生活简易建议,可有效降低老年痴呆症的风险。
 
研究称,痴呆症的病理生理特征出现在临床症状出现前的 15~20 年,突出了长期随访确定危险因素和保护因素的必要性。
 
相关论文信息:https://doi.org/10.1136/bmj.l4414
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