会议期间，为获得"2016年中国实验动物学会科学技术奖"的单位进行了表彰并颁发证书。其中由成都军区昆明总医院、广东省实验动物监测所、中国医学科学院医学生物学研究所、昆明市第一人民医院共建的《实验猴病理基础数据库及标准检测体系建设与应用》获得科学技术奖一等奖。中国农业科学哈尔滨兽医研究所的“SPF巴马小型猪的培育及应用”等6个项目获得”2016年中国实验动物学会科学技术奖”二等奖；首都医科大学的“长爪沙鼠脑缺血模型高发封闭群的培育和脑血管畸形相关基因的筛选”等7个项目获得”2016年中国实验动物学会科学技术奖”三等奖。

科学技术一等奖

科学技术二等奖

科学技术三等奖