4月19日下午，在2024年(第十一届)北京实验动物科学国际论坛“实验动物领域优秀青年科学家专题论坛”上，首都医科大学实验动物部孙铭壑老师作了题为“中国地鼠SNP遗传检测方法的建立与应用”的报告。

孙老师指出中国地鼠是中国的特色实验动物，明确它的遗传背景对其作为实验动物方面的价值有重要意义。

孙老师详细介绍了研究团队的研究成果：研究团队基于单核苷酸多态性（SNP）标记，建立一个用于监测中国地鼠遗传背景的、经济高效的遗传质量检测系统。为了寻找 SNP，本研究对24 只中国地鼠进行全基因组测序后，首先建立了可靠的筛选 SNP 标准，初步筛选出在基因组内分布广泛、多态性较好的 SNP 位点。在全基因组测序结果的基础上，初步筛选出 214 个 SNP 位点。接着，在研究基础上基于二代测序的目标区域捕获技术对中国地鼠两个群体进行遗传检测，建立并优化了包括 55 个 SNP 位点的遗传检测系统。然后用PopGene.32 软件对两个中国地鼠群体进行分析，结果表明中国地鼠 A 群体的平均有效等位基因数、平均香农指数、平均观察杂合度、平均期望杂合度、平均杂合度和平均多态性信息含量等群体遗传学参数均大于中国地鼠B群体。该研究还筛选到了7个群体特异性的SNP位点。此外，还用55个SNP 位点和7个群体特异性的 SNP 位点进行PCA主成分分析。得出研究结论：通过建立科学严谨的筛选和优化步骤，首次成功建立了适用于中国地鼠的 SNP 标记检测方法，该系统兼备灵敏性、特异性、可靠性和经济性。

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